Ekstrak tanaman obat yang dikandung di dalam Minyak Bokashi diteliti lebih dalam.  Hasilnya, Minyak Bokashi mengandung senyawa flavonoid.  Senyawa flavonoid itu merupakan antioksidan yang ada di dalam tanaman obat.  Fungsi flavonoid bagi tanaman adalah untuk melindungi struktur sel tanaman, sebagai warna/ pigmen tanaman, menghambat serangan penyakit tanaman, membantu pembentukan bintil akar, mewarnai bunga untuk menarik hewan penyerbuk.  Flavonoid terdapat dalam bunga, buah,umbi-umbian,   sayur, teh dan tanaman obat yang berguna untuk makanan, makanan suplemen kesehatan, dan obat alami.

Fungsi flavonoid untuk kesehatan adalah sebagai anti bakteri, anti jamur, anti virus, anti inflamasi.  Fungsi tersebut bisa terjadi karena flavonoid termasuk antioksidan yang menghambat atau mencegah terjadinya penyakit, pembusukan, infeksi mikroorganisme penyakit, menyembuhkan luka, bengkak, dan menetralkan senyawa yang bersifat racun.  Flavonoid juga berfungsi untuk meningkatkan imun tubuh dan mempercepat penyembuhan penyakit.

Penyembuhan penyakit dengan Minyak Bokashi berdasarkan teori penyembuhan antioksidan.  Antioksidan dapat menghambat proses oksidasi/ penyakit di dalam tubuh.  Antioksidan berfungsi menghambat perkembangan penyakit melalui cara anti bakteri, anti jamur, anti virus.  Jenis antiokasidan yang terkandung dalam Minyak Bokashi adalah flavonoid.