Di dalam rumah tangga sangat banyak menghasilkan limbah, yang disebut limbah rumah tangga, yang bersumber dari dapur, kotoran manusia, kotoran binatang kesayangan.  Lingkungan di rumah tangga yang sering kita injak dan duduki, misalnya lantai rumah, halaman rumah dari tanah/ rumput, mengandung mikroorganisme penyakit yang kita bawa dari luar dan hidup menetap di sana.  Dapur yang kotor/ tidak bersih, karena limbah dan aliran airnya yang kurang bagus menyebabkan berbau kurang sedap, yang menandakan proses pembusukan sedang terjadi dalam lingkungan dapur.  Toilet dan lantai toilet, serta septik tank, yang ditinggali secara dominan oleh bakteri pembusuk  akan menimbulkan gas-gas busuk.   Lingkungan rumah tangga yang kurang sehat akibat limbah rumah tangga dan aktivitas di dalam rumah tangga yang mendukung berkembangnya bakteri pembusuk dapat mengganggu kesehatan manusia yang tinggal di dalam rumah.   Di sinilah peranan probiotik EM4 untuk memfermentasi bahan organik dan menekan bakteri pembusuk yang hidup dalam lingkungan rumah tangga, serta bakteri fotosintetik yang memakan gas-gas dan senyawa beracun yang dihasilkan oleh bakteri pembusuk.

Larutkan 1 liter EM4 ke dalam 100 liter air, kemudian tuangkan ke dalam saluran air limbah, sambil membersihkan bak pencuci peralatan dapur.  Hal yang sama juga dilakukan dengan menuangkannya ke dalam toilet dan lantai kamar mandi sambil membersihkannya.  Pembersihan/ penyiraman EM4 ke saluran air limbah dapur dan toilet bisa dilakukan setiap minggu dua kali.  EM4 dicampurkan ke dalam satu ember air (10 liter) dimasukkan  EM4 10 ml (dua sendok makan), kemudian digunakan untuk mengepel lantai.  Air kotor yang ada di dalam ember sehabis mengepel disiramkan ke dalam pot tanaman atau ke dalam got.  Ngepel lantai dengan menggunakan larutan air dan EM4 bisa dilakukan setiap hari.  Limbah dapur organik (sisa-sisa makanan) dikumpulkan dalam ember dan disiramkan EM, selanjutnya air tirisannya tersebut diencerkan ke dalam air (1:10) bisa disiramkan ke akar tanaman.  Sisa-sisa makanan yang terfermentasi tersebut ditanam ke dalam tanah/ pot tanaman.  Jika ada hewan kesayangan tinggal di rumah, seperti anjing, kucing, ayam, burung, hamster, tupai,kelinci, dsb, maka dia bisa dimandikan dengan sabun dan dibilas dengan EM4 yang dilarutkan ke dalam air, agar binatang kesayangan tumbuh sehat.

Dengan penggunaan probiotik EM4 ke dalam lingkungan rumah tangga, probiotik hidup dan menjaga proses pembusukan bahan organik menjadi rendah, lingkungan rumah tangga menjadi bersih, dan sehat, serta bebas dari polusi bau gas busuk, tanaman menjadi subur, binatang kesayangan menjadi sehat.